La maestría está centrada en la formación clínica psicoanalítica, con una base conceptual sólida en psicología, psicopatología y teoría psicoanalítica. El programa parte de la obra de Sigmund Freud y posteriormente profundiza en la tradición del psicoanálisis inglés: Melanie Klein, Donald Winnicott, Wilfred Bion y Donald Meltzer, además de corrientes contemporáneas del psicoanálisis francés. La formación se organiza en torno a seminarios donde los estudiantes analizan textos fundamentales, discuten casos clínicos y desarrollan habilidades interpretativas. A partir del tercer semestre, los alumnos comienzan prácticas clínicas supervisadas en el Hospital General de México.